Home
Browse
Blast
Tools
Download
Help

Basic information


Strain: Yersinia enterocolitica subsp. palearctica 105.5R(r)

T3SS: Yer3     T3SS_Category: IIId

Genome_ID: NC_015224.1     Strand: +     Coordinate: 389880..391361

Locus_Tag: YE105_C0312


Gene information


Gene_name: SctC     Gene_acession:

Nucleic acid sequence:

ATGAAAGAGCTTGCTGGTGCGCTACTGTTACTATTTATGTCCCAGGCCTCAGGGAAAGCCATTCCCTGGCAGGGGGAGCC
TTTTTTTATTTATAGCCGAGGCATGAAAGTCACTAACTTGTTGAATGATCTTGGGGTGAATTATGGTATCCCTGTGGTCG
TTAGCCCAGAAATAAATGAAAAATTTAGCGGTAAAATAGTGGATAAAACACCAGACCAAATACTGTCAGAATTGGCTGGG
CTATATAATATTACTTGGTACTACGATGGGGATATTCTCTATTTCTACAAAACTCAATCTATCAAAAGAGAGTTTATATC
TCCTGATGGGCTATCGACGGGGACCTTAATCAAATATTTAAAGCAAAGTGGTGTTCCCGCAGGTAAAAATTGCGCCGTAC
AGGCTGTTTCTCGCCTTAATGCAATTGAGGTCACAGGGGTACCTATCTGTATTGAACGTGTGACTTCTCTGACTAAAATG
CTCTCTTCGCAAGTGCGTAAGCAAAATCAAAATAAAGAAACAGTAAAAGTTTTTCAGTTAAAATATGCTTCTGCGGCTGA
CTCCACATATCAATATCGGGATCAACAAGTTCAGTTACCGGGTTTGGTCAGTGTCCTGCGGGAAATGAGTGCAGGTAACC
ATTTACCTTTGGCAGGCGAAAAAGAATCAGAGGATGCCCCTGTCAGCGCGCCACTTTTTTCGGCTGACCCTCGGCAAAAT
GCAGTTATTATCCGTGATCGCCAAGCGAACATGCCGCTGTATAGTAGTTTGATTACACAGTTGGATCAGCGGCCCGTCCA
AATAGAAATTTCTGTGACGATTATTGATGTTGATGCTGGGGATATCAGTCAGCTTGGTATCGATTGGTCAGCATCCACAT
CGATTGGTGGCGCTGGGGTTTCATTTAACAGTGGGGAGGCAGCACCTCATTCAGATGGATTCTCCACTGTGATAGGTAAC
ACCGGAAATTTTATGGTGCGCTTGAACGCCTTGCAAAAGAATTCGCGCGCCAGGGTTTTATCCCGCCCTTCAGTGGTTAC
CTTGAATAATATTCAAGCTGTACTAGACAAAAACGTGACTTTTTATACCAAGCTGCAAGGCGACAAGGTTGCAAAACTTG
AATCAATAACATCAGGTTCATTATTACGAGTCACACCGCGAATGATTGATTCTGACGGTGTGAAAGAAGTTTTACTTAAC
CTCAATATTCAAGACGGCCAACAGCAGGCACCACTCAGTAGTAGTGAACCTTTGCCTGAAATTCAAAATTCAGATATTTC
GACGCAAGCGACATTACGGGTTGGACAAAGCTTGCTCTTGGGTGGGTTTATTCAAGATAAACAAATTGAATCACAAAACA
AAATTCCTTTATTGGGTGATATCCCCTTACTCGGTGGATTGTTTCGCAGTACTAATAAGCAATCTCACAGTGTTGTCAGG
CTATTTTTAATCAAAGCCGTACCGGTTAATACAGGGGAATAA


Protein information


Protein_Function: Apparatus     Protein_acession: YP_004296513.1

Protein sequence:

MKELAGALLLLFMSQASGKAIPWQGEPFFIYSRGMKVTNLLNDLGVNYGIPVVVSPEINEKFSGKIVDKTPDQILSELAG
LYNITWYYDGDILYFYKTQSIKREFISPDGLSTGTLIKYLKQSGVPAGKNCAVQAVSRLNAIEVTGVPICIERVTSLTKM
LSSQVRKQNQNKETVKVFQLKYASAADSTYQYRDQQVQLPGLVSVLREMSAGNHLPLAGEKESEDAPVSAPLFSADPRQN
AVIIRDRQANMPLYSSLITQLDQRPVQIEISVTIIDVDAGDISQLGIDWSASTSIGGAGVSFNSGEAAPHSDGFSTVIGN
TGNFMVRLNALQKNSRARVLSRPSVVTLNNIQAVLDKNVTFYTKLQGDKVAKLESITSGSLLRVTPRMIDSDGVKEVLLN
LNIQDGQQQAPLSSSEPLPEIQNSDISTQATLRVGQSLLLGGFIQDKQIESQNKIPLLGDIPLLGGLFRSTNKQSHSVVR
LFLIKAVPVNTGE