Home
Browse
Blast
Tools
Download
Help

Basic information


Strain: Citrobacter freundii.CAV1321

T3SS: Cit1     T3SS_Category: II

Genome_ID: NZ_CP011612.1     Strand: +     Coordinate: 332716..334746

Locus_Tag: AB180_RS04710


Gene information


Gene_name: SctV     Gene_acession:

Nucleic acid sequence:

ATGTGGCAAAAAATAGCAAAGAAACCAGAATTGTTTTTGGTTGTATTGATGATATTAATATTAGCCATGTTGATTATACC
ATTACCAACATGGCTTATTGACGTACTATTAGCTTTTAATATTACATTTTCTATTTTAATTTTTATTGGCACGTTTTATA
TACAGAAAGTGTTGGAATTTTCTGCATTGCCTTCCCTTTTGCTCATTACAACGCTCTTTCGTCTTGCGTTATCTATCAGT
ACCAGTCGTATGATACTGGTGCAGGCTGATGCAGGACATATTATTACAACATTTGGCAATTTTGTTATTGCAGGGGATAT
TGTTGTTGGCTTTATCATTTTTTCAATTGTTACACTTTTTCAATTTATTGTTATAACAAAAGGTTCAGAGCGTGTCGCAG
AAGTTAGTGCGCGCTTTTCTCTGGACGCCATGCCCGGTAAACAGATGAGTATTGATGCAGACTTGCGAGCGGGAAATATT
GATGCTGATGATGCCCAGCGGCGACGCTCCATGCTGGAAAAGGAGAGCCAACTGTATGGTGCATTAGATGGTACAATGAA
ATTTATCAAAGGTGATGCAATTGCCAGCATTGTGATTATCTTTGTCAATTTCATTGGTGGCGTTTCTATTGGTATGGGTC
GTCATGGTATGTCCTTTAGTGGGGCTACCGATGTCTATACGATTTTAACAATTGGCGATGCCTTGGTCGCTCAGATTCCC
GCTTTACTTATTTCTATCGGTACCGGCTTTGTGGTAACAAGGGTTAGTGAGGATGGGAAAAATCTGGGTAACAATATCAT
TGATCAGATTTTCCAACGTGATTTTGTTTTGATTGTAACGGCAATTGTAGCCATTTTAATTGGTTGTCTTCCGGGATTTC
CATTGATAGTTTTTATGCTTATAGCCAGCATCATTCTTGCTGTTTTTTTTAACCGTACTGTGAAAGCTAAAAAGCAGGCA
ACGTCTTTCGGGAGTATAAAAACGGAGCCAGGAGGGAGTTCTGGTAGTGAAGGATATACACTTTTGCCCACAGCAAATAT
TATACCTGAAACTGTACCGTTGATGGTAATGCTCCCAGAGCAGGATTTTAGCAATCTGGATATTGAACATTTTGGCATGC
GCTTTTCACAGGACTTTTATCTTAACTATGGCATTGAACTCCCGAAAGTCAGTGTAATAATGAGCCCAAACGTACAGTTA
AACCATGTTGTTGTCCTGATCAATGAAGTTACTGCAGGTGTATTTCCAATTAAATTTGGATATTTCAAACTTTTGAATCT
TGATGGCATTATTGATTTTCCAGGTATTGATATAATCATCACTGAATATGGAAATGAAAAAGAATACTGGGTCGCCGAAC
AGAACCAAGAGTTATGTTCATCTTTGGGATTTACGTTGCGTTCGGCAGAAGATGAAATGATGCTCTCTTTTCAGCTGCTG
GTGACCGCACAGATCCCTGAGTTGTTTGGCATTCAGGAAACCAAAAACATCATGGATAAATTTGAACGCCAGTATCCTGA
GTTATTAAAGGAAACGTACAGGCACTGTACTGTCCAGCGAGTATCTGAAGTCTTACAACGTTTGTTAAGTGAACGTATTT
CAGTAAGAAATATGAAAGCAGTGCTTGAAGCGTTGGCGATGTGGGGCGGGAAAGAGAGAGATACGATCCAGTTGGTAGAG
CATGTGCGCAGTGCGCTAGCGCGCTATATTTCGGATAAGTTTTCCACTGAAAATGTATTATCAGTTATGGTGTTATCACC
TGAGATTGAAAATAAAATCCGAAAGGGAATTAAAACATCTGCTTCTGGATCATTTATCAATATGGAACCGGCAGATAATG
AGTTTGTTATTGATAGGTTTGAGCATCATTTATTGAATCTTTCACGAAAGGATGTTGTATTTTTAACTGCAGTTGATATC
AGACGCTATACTAAACGTTTGATAATGTCGCAATTTACTGATCTGGATGTCATTTCATTTGGCGAAATATCAGAAAGTGT
TAAAGTTAACGTAATCAAAATGGTGGATTAA


Protein information


Protein_Function: Apparatus     Protein_acession: WP_044700269.1

Protein sequence:

MWQKIAKKPELFLVVLMILILAMLIIPLPTWLIDVLLAFNITFSILIFIGTFYIQKVLEFSALPSLLLITTLFRLALSIS
TSRMILVQADAGHIITTFGNFVIAGDIVVGFIIFSIVTLFQFIVITKGSERVAEVSARFSLDAMPGKQMSIDADLRAGNI
DADDAQRRRSMLEKESQLYGALDGTMKFIKGDAIASIVIIFVNFIGGVSIGMGRHGMSFSGATDVYTILTIGDALVAQIP
ALLISIGTGFVVTRVSEDGKNLGNNIIDQIFQRDFVLIVTAIVAILIGCLPGFPLIVFMLIASIILAVFFNRTVKAKKQA
TSFGSIKTEPGGSSGSEGYTLLPTANIIPETVPLMVMLPEQDFSNLDIEHFGMRFSQDFYLNYGIELPKVSVIMSPNVQL
NHVVVLINEVTAGVFPIKFGYFKLLNLDGIIDFPGIDIIITEYGNEKEYWVAEQNQELCSSLGFTLRSAEDEMMLSFQLL
VTAQIPELFGIQETKNIMDKFERQYPELLKETYRHCTVQRVSEVLQRLLSERISVRNMKAVLEALAMWGGKERDTIQLVE
HVRSALARYISDKFSTENVLSVMVLSPEIENKIRKGIKTSASGSFINMEPADNEFVIDRFEHHLLNLSRKDVVFLTAVDI
RRYTKRLIMSQFTDLDVISFGEISESVKVNVIKMVD