Home
Browse
Blast
Tools
Download
Help

Basic information


Strain: Yersinia ruckeri ATCC 29473

T3SS: Ysa-c     T3SS_Category: IIa

Genome_ID: JPPT01000003.1     Strand: -     Coordinate: 584238..585485

Locus_Tag: DJ39_527


Gene information


Gene_name: SctD     Gene_acession:

Nucleic acid sequence:

ATGACATATCCGTATGCCACTGATATACCTAAAGCCATCCCTGAGACAGGATCTATTCTAATGGATAATATGAGTACTGA
ACTCTACATAATAAAAATTGCCTTCGGGCCAATGGCGGGTACTGAACTGTTGGTCAAGCCCAACTTCTGCCAGATCGTCG
TAGCCCCGGGTATCGAATACGAAACAGTGACGGAGGAAGACTCCGAGTTAACAACCTATTCTTTACCGACTGATGAAGGT
GAGTACAAATTTACACTGCATCGTCAAAGCGATAGTGAGGATTTACCTGGTGGCCTATATGCCATATTGGAAGATAGCGA
GAAACGACATGAACGTATTGATATCGTTTTTCATACTCTATTATTTGCTGACAATTTTCCGATACTGATTAAACCAGTCA
ATGATGAGTGGCACTACAATTCACAGGTATTACCTGCGGATAAGCATAACCCAACTCTCATAGAAAATCTGGAATTGTCA
GAGAAAGTAAGAAAAAATAAATTAAAGCCGCTTCCCTGCTTGGTGATTTTTATTTTGTTGATTGCCGGTCTCTTTGCCTT
TATTTTGGCCAGTGGAGATAAGGACTCGCAAAAAATCATTACACTTTCAGAATTATTAGCCGGTAGCTCGGCTCCCTTGA
CGATACTTAATTCAGGTGAGAATACGAGTTTGATACTGGCGAAAACACAGCGGGATATGGATTGGGTTTCTCAGCGATTG
ATCACTGAGAGTTATTCAGGACAAGCTACAACTAAACTTATTCATAGTTTTGAGAAAGAATTGGAAGCCTTAGTGCAAAC
AAGTACAGGTTCAGTACTTAAAGTTGATCTCACTACGCCATGCTCTCCCTTGGTTAAGCTAGTCAGAAGGATTAATAACC
AAACAGAAATAGAAACGATTAAAACCACTGTGCGGTCAAAACTAAAATGTGCCAACCAGATTGAGATCAAAAGCTATGAC
AGAAAAGATATTCTTGACGAAGCGATTAATGGTATAAAATCCAATAACATTCCTTTCAAGTTAATTAATGACAGTAAAAA
ACCGGTCATTATTGTTAACACCGACCTTAATGATAAGCAGTTTATGTCATTAATTAAATTTGTAACCGAGTTTAATCAGA
ATTGGGGCGATAACTATGTTCAGTTCTCAATTTCATTAGCTACCGATTATCTGGCAGGAAAATCATTTTTGAATAGTCAA
AGTGGTTATATCTTGTTAGACAATAATCATTGGTATTTTAAACAATAA


Protein information


Protein_Function: Apparatus     Protein_acession: KGA49343.1

Protein sequence:

MTYPYATDIPKAIPETGSILMDNMSTELYIIKIAFGPMAGTELLVKPNFCQIVVAPGIEYETVTEEDSELTTYSLPTDEG
EYKFTLHRQSDSEDLPGGLYAILEDSEKRHERIDIVFHTLLFADNFPILIKPVNDEWHYNSQVLPADKHNPTLIENLELS
EKVRKNKLKPLPCLVIFILLIAGLFAFILASGDKDSQKIITLSELLAGSSAPLTILNSGENTSLILAKTQRDMDWVSQRL
ITESYSGQATTKLIHSFEKELEALVQTSTGSVLKVDLTTPCSPLVKLVRRINNQTEIETIKTTVRSKLKCANQIEIKSYD
RKDILDEAINGIKSNNIPFKLINDSKKPVIIVNTDLNDKQFMSLIKFVTEFNQNWGDNYVQFSISLATDYLAGKSFLNSQ
SGYILLDNNHWYFKQ