Home
Browse
Blast
Tools
Download
Help

Basic information


Strain: Hafnia albertii KF1

T3SS: Haf1     T3SS_Category: IIb

Genome_ID: NZ_CP007025.1     Strand: +     Coordinate: 3307842..3309902

Locus_Tag: EAKF1_RS16435


Gene information


Gene_name: SctV     Gene_acession:

Nucleic acid sequence:

ATGTTTAATAAGGTTCTGATAGGTTTACGTAGCCACCCAGAATTAATTATTTTAGGGTTAATGGTGATGATTATCGCCAT
GCTTATCATTCCATTACCAACCTACCTTATCGATTTTTTAATTGGTCTCAATTTAACATTGGCTATTTTAGTTTTTTTAG
GATCATTTTATGTAGATAGAATACTGAGCTTTTCATCATTTCCTTCAATTCTTCTTATAACCACTTTGTTTCGTTTAGCA
CTCGCTATCAGTACCAGTCGACTCATACTCCTTGAGGCTGATGCTGGGGAAATTATCACAAGTTTTGGTGAGTTTGTTAT
TGGGGACAGCCTTATTGTTGGTTTTGTTATATTTTCAATTGTAACCATTGTTCAGTTTATCGTGATTACTAAAGGATCTG
AGCGCGTGGCGGAAGTTGCGGCCCGCTTTTCTCTCGATGGTATGCCTGGTAAACAAATGAGTATCGATGCAGATTTACGA
GCCGGTATTATTGATGCAGAAGCAGCCAAAGAACGACGGAGTGTTTTGGAACGAGAAAGCCAATTGTATGGCTCGTTTGA
TGGCGCGATGAAGTTTATAAAAGGCGATGCAATTGCTAATATTATTATTATATTTGTCAACATAATTGGTGGGTTATCAG
TCGGGGTAGGTCAGAATGGAATGGATTTCTCAACGGCATTAACCGTTTATACTATTCTTACTGTGGGAGATGGACTTGTC
TCTCAAATACCAGCTCTGTTAATAGCTATTAGTGCCGGTTTTATTGTTACACGTGTAAATGGTGATAGTGACAATATGGG
GAAAAATATAATGTCACAATTGTTAAGTAATTCATTTGTAATTATAGTTACCTGCGTTCTTGCATTAAGTATAGGATTGT
TACCGGGGTTTCCTCTTGCCGTTTTTTTATGTCTGGCATTTATACTTGGGATTTACTTTTATTTTAAATTTGAGAAGAAA
GATACAGAGAACACGGCTACTGAAGATGAAATATCACTTGGCCTGGAGCCTTATAATCAGAATGATGATATCTCGTTGGG
CATTATTAATAAACTGGATCAAGTTATTACCGAAACTGTTCCGCTTGTTCTGATTATGAATAGTAAACAGGCCAAAAAGT
ATACTGATATTAATCTTGCAGACAGAATTCGTAGCCAGTTTTTTATCGAATATGGAATTCGCATACCTGGAATTGTTATT
CGTGAGGGGGATGGACTTAATGATGAAGATGTAATATTGATGTTGAATGAAGTTAGGGCCTCTCAATTTAAGATCTATCA
TGATATGGTATTGCTGATAGAGTATTCTGATGAGATTTTTTCGGCGCTCTTAAAAAAAACAGTGATAGTGAACAGCAATG
GAGAACAATATTATTGGGTTACGAAAAATGATGCTCAGAAATTAACAAGAATCGGCTGCTATACACGCACAGCTATGGAT
GAAATGTATAATCATTTATCTGTTTGTCTTGCTCATAATATCAATGAGTATTTCGGTATACAAGAAACAAAATATATTCT
TGATCAGCTCGAGGTAAAATATCCTGATCTACTAAAGGAAATACTGCGTTATATTACCGTACAGCGCATATCTGAAGTAA
TTCAGCGATTAATTCAGGAGCGTATTTCAGTTCGCAACATGCGGCTGGTTATGGAAGCATTAGCACTATGGAGTCCAAGA
GAGAAGGATATCATTACCCTCGTTGAACATGTTCGAGGGGCACTTGGGCGCTATATATGTCATAAATTTTCATATTCTGG
AGAGATAAAAGCAGTCGTTATTTCACCAGAGATAGAAGATCGAATAAGAGACGGAGTTAGACCAACGGCAGGTGGAACTT
TCTTAAATCTTGATGCATCCGAGGCTGAGATGATTCTTGATAATTTTAAATTGGCGCTTTCAGGTATTAACATACCTATT
AAAGATATTGTTTTACTTGGTTCTGTAGATATTAGACGTTTTATCAAAAAGTTAATTGAATCTAATTATCGTGATCTTGA
AGTTCTATCTTATGGAGAACTGACAGAAAATGTTTCTATAAATATTCTAAAAACTATCTAG


Protein information


Protein_Function: Apparatus     Protein_acession: WP_025238441.1

Protein sequence:

MFNKVLIGLRSHPELIILGLMVMIIAMLIIPLPTYLIDFLIGLNLTLAILVFLGSFYVDRILSFSSFPSILLITTLFRLA
LAISTSRLILLEADAGEIITSFGEFVIGDSLIVGFVIFSIVTIVQFIVITKGSERVAEVAARFSLDGMPGKQMSIDADLR
AGIIDAEAAKERRSVLERESQLYGSFDGAMKFIKGDAIANIIIIFVNIIGGLSVGVGQNGMDFSTALTVYTILTVGDGLV
SQIPALLIAISAGFIVTRVNGDSDNMGKNIMSQLLSNSFVIIVTCVLALSIGLLPGFPLAVFLCLAFILGIYFYFKFEKK
DTENTATEDEISLGLEPYNQNDDISLGIINKLDQVITETVPLVLIMNSKQAKKYTDINLADRIRSQFFIEYGIRIPGIVI
REGDGLNDEDVILMLNEVRASQFKIYHDMVLLIEYSDEIFSALLKKTVIVNSNGEQYYWVTKNDAQKLTRIGCYTRTAMD
EMYNHLSVCLAHNINEYFGIQETKYILDQLEVKYPDLLKEILRYITVQRISEVIQRLIQERISVRNMRLVMEALALWSPR
EKDIITLVEHVRGALGRYICHKFSYSGEIKAVVISPEIEDRIRDGVRPTAGGTFLNLDASEAEMILDNFKLALSGINIPI
KDIVLLGSVDIRRFIKKLIESNYRDLEVLSYGELTENVSINILKTI