Home
Browse
Blast
Tools
Download
Help

Basic information


Strain: Shigella flexneri 2002017

T3SS: Shi-p     T3SS_Category: IIb

Genome_ID: NC_017319.1     Strand: +     Coordinate: 122613..124313

Locus_Tag: SFXV_RS25850


Gene information


Gene_name: SctC     Gene_acession:

Nucleic acid sequence:

ATGAAAAAATTTAATATTAAATCTTTGACTCTCTTGATTGTATTGTTACCATTGATAGTTAATGCTAATAATATTGACTC
TCATTTATTAGAACAAAATGACATAGCGAAATATGTTGCTCAAAGTGATACGGTAGGATCTTTTTTTGAACGTTTTTCTG
CGTTATTAAATTATCCTATTGTTGTTAGCAAACAAGCTGCAAAAAAGAGAATATCTGGGGAGTTTGATTTATCTAATCCA
GAAGAAATGCTTGAAAAACTGACATTACTTGTGGGACTCATATGGTATAAAGATGGAAATGCATTATACATATATGACTC
TGGAGAATTAATAAGCAAAGTTATTTTGCTGGAGAATATATCACTTAATTATCTTATTCAGTATCTGAAGGATGCTAACC
TTTATGATCACAGATATCCTATAAGAGGAAACATTAGTGATAAAACATTCTATATATCTGGTCCTCCGGCATTGGTTGAA
CTGGTAGCTAATACAGCAACTTTGCTTGATAAGCAGGTTTCTTCTATTGGGACAGATAAAGTTAATTTTGGGGTTATAAA
ATTAAAAAATACATTTGTTAGTGACAGAACTTATAATATGAGAGGGGAGGATATTGTCATCCCAGGGGTGGCTACTGTTG
TAGAACGTTTATTAAATAATGGTAAGGCTCTGAGTAACAGACAAGCCCAAAATGATCCGATGCCACCCTTTAATATTACA
CAGAAAGTATCTGAGGATAGTAATGACTTTTCATTTAGTTCAGTTACCAATAGTTCTATATTAGAGGATGTATCACTTAT
TGCATATCCAGAAACCAATTCTATATTAGTCAAAGGTAATGATCAGCAAATACAGATTATTCGCGATATTATCACTCAGT
TAGATATAGCCAAACGACATATAGAATTATCATTATGGATAATCGATATTGATAAATCTGAATTAAATAACCTTGGTGTT
AATTGGCAAGGAACGGCTTCATTTGGTGATTCGTTTGGTGCGTCATTTAATATGAGCTCATCAGCATCGATAAGCACTTT
GGACGGCAATAAGTTTATTGCTTCAGTTATGGCATTAAATCAGAAAAAGAAAGCAAATGTAGTTTCAAGGCCGGTGATTT
TGACACAAGAGAATATTCCGGCTATATTTGATAATAACAGGACTTTTTATGTGTCATTAGTTGGTGAGCGCAATTCTTCG
TTGGAGCATGTTACGTATGGAACATTGATAAATGTTATACCTCGCTTTTCATCTCGGGGACAAATTGAGATGTCTTTAAC
GATAGAGGATGGAACAGGAAATAGTCAGTCAAATTACAATTATAATAATGAAAATACATCTGTCCTTCCAGAAGTTGGAA
GGACCAAAATCAGTACAATAGCGAGAGTTCCACAAGGCAAAAGTTTGTTGATAGGTGGTTATACGCATGAAACGAACTCT
AACGAAATAATATCTATTCCTTTTCTCTCCTCTATTCCTGTAATCGGTAATGTGTTCAAGTATAAAACAAGTAATATCAG
TAATATTGTAAGGGTTTTTCTGATTCAACCCCGTGAGATAAAGGAGTCAAGTTATTATAATACTGCAGAATATAAAAGCC
TCATATCTGAAAGAGAAATACAAAAGACTACACAAATAATCCCATCTGAAACTACTTTGCTGGAAGACGAAAAATCATTG
GTTTCATACTTAAATTACTAA


Protein information


Protein_Function: Apparatus     Protein_acession: WP_000714357.1

Protein sequence:

MKKFNIKSLTLLIVLLPLIVNANNIDSHLLEQNDIAKYVAQSDTVGSFFERFSALLNYPIVVSKQAAKKRISGEFDLSNP
EEMLEKLTLLVGLIWYKDGNALYIYDSGELISKVILLENISLNYLIQYLKDANLYDHRYPIRGNISDKTFYISGPPALVE
LVANTATLLDKQVSSIGTDKVNFGVIKLKNTFVSDRTYNMRGEDIVIPGVATVVERLLNNGKALSNRQAQNDPMPPFNIT
QKVSEDSNDFSFSSVTNSSILEDVSLIAYPETNSILVKGNDQQIQIIRDIITQLDIAKRHIELSLWIIDIDKSELNNLGV
NWQGTASFGDSFGASFNMSSSASISTLDGNKFIASVMALNQKKKANVVSRPVILTQENIPAIFDNNRTFYVSLVGERNSS
LEHVTYGTLINVIPRFSSRGQIEMSLTIEDGTGNSQSNYNYNNENTSVLPEVGRTKISTIARVPQGKSLLIGGYTHETNS
NEIISIPFLSSIPVIGNVFKYKTSNISNIVRVFLIQPREIKESSYYNTAEYKSLISEREIQKTTQIIPSETTLLEDEKSL
VSYLNY