Home
Browse
Blast
Tools
Download
Help

Basic information


Strain: Vibrio tasmaniensis 1F-187

T3SS: Vib1-c     T3SS_Category: Ib

Genome_ID: NZ_AJZM01000029.1     Strand: +     Coordinate: 9535..11652

Locus_Tag: A152_RS0101885


Gene information


Gene_name: SctV     Gene_acession:

Nucleic acid sequence:

ATGAATAAGTTGATCGATATTATTAACAAGGTTGGGCAGCGTAAAGACATCATGCTTGCCGTGATGCTACTGGCAATCGT
CTTTATGATGATCTTGCCTTTACCTACGACATTGGTGGATGTACTTATCGGTACCAACATGAGTATAGCGGTCGTCTTAT
TGATGATTGCTATCTACATTACATCCCCCCTAGAGTTCTCTGCATTCCCAGCGGTTCTGTTGATCACTACACTATTTCGC
TTGTCACTTTCTATCACTACAACACGACTTATCCTGCTGCAAGGTGATGCTGGTCAAATCGTTTCTACCTTTGGTAACTT
CGTCGTGGGTGGTAACCTGGTCGTGGGCATCGTAGTTTTCCTGATCATCACAATCGTTCAGTTTATGGTGATTACTAAAG
GTTCAGAAAGGGTAGCGGAAGTCAGTGCTCGATTCTCCCTTGATGCGATGCCGGGTAAGCAAATGAGTATAGACGGCGAT
ATGCGCGCCGGGGTAATCGATGTTCATGAGGCGCGTCATCGCCGTTCAGTGATTGAAAAAGAAAGCCAAATGTACGGCTC
TATGGACGGGGCGATGAAGTTCGTAAAAGGAGACTCTATTGCTGGTCTGGTGATAATCGTGGTGAATATTCTTGGCGGTG
TAACCATAGGTGTGACTCAAAAAGGCATGTCAGCGTCGGAAGCATTGGAGCTATTTGCTGTTTTGACCGTAGGTGATGGC
CTGGTATCGCAAATTCCGGCTCTCTTTATCGCGATTACTGCCGGTATTATTGTGACGCGCGTTTCGAATGAAGAGTCCTC
TGACCTAGGCTCAGATATCGGAGCACAGGTTACAGCACAACCAAGAGCTTTGTTGATTGGCGGTGTGTTGCTAGTGTTGT
TTGCGCTTATTCCCGGTTTCCCGAAGGTTACCTTCTTTGTTCTTGCTATTGTAGTCGGTGGTGGCGGCTTTTTCTTACTC
CATAACAAAAAACAACAAAGTAAATTAAGCAGTGCCGACTTACCAAGTTTTGTTGCCCAAGGCGCGGGCTCGCCAGCCGC
CAAATCGAACAAAGCGGCACCTCAGCGCAACAGCAAAGGAAAACTAGGTGAACAAGAAGAGTTCGCTATGACGGTACCGC
TGCTAATCGATTTGGATGCTCGCTTACAAGAGAGCTTAGAAGCCGTCGCTTTGAATGATGAGCTCGCACGAGTAAGACGA
GCGTTGTACCTAGATCTCGGCGTGCCGTTCCCGGGGATTCACTTACGATTTAACGAAGGGATGAGCAACGGTGAATACTT
GATTCAATTGCAAGAAGTGCCAGTTGCCCGCGGTCGGATTCAAAGCTTAAAACTGCTGGTGACAGAAGATAATGAGCAGA
TCGATTTGCTTGGTATACCTTACGAGAAAGATGACGATTTTCTACCGGGAATTTCGAGTATTTGGGTAGACCACAGTCAT
AAAGTAAAACTAGAAAACAGCCAAGTGGGCTTTTTAACTCCCGACCGTATTTTGACTTACCACCTATCTCATGTGCTAAA
AGAGTACGCCCAAGATTTTATCGGTATCCAAGAGACTCGTTATTTGCTAGAGCAAATGGAAGGCAGTTATTCCGAATTAG
TAAAAGAGACACAGCGTATTGTGCCTTTGCAAAAAATGACGGAAATCCTACAACGCCTTGTCTCTGAGGATATTTCTATT
CGTAACTTACGAGTGATCTTAGAAGCAATGGTGGAGTGGGGACAAAAAGAAAAAGACGTGGTTCAGTTGACTGAATACAT
CCGTTCAAGTTTGAAACGCTATATTTGTTACAAGTACGCCAGCGGTCAAAATATGTTGCCAGCATACCTGTTAGATCAGA
GCTTGGAAGATATGCTCCGTAACGGTATTCGTCAGACTTCGTCGGGCAGTTACTTAGCGCTTGACCCTTCCGTTACTCAA
CAGTTTGTCAGCGACGTTAAGCAAGCAGTTGGTGATTTGAGCCGTATGCCAAATAAACCAGTGTTAGTGGTGTCAATGGA
CGTACGCCGTTACGTGCGAAAATTGATTGAATCTGAATACTACGATCTGCCAGTGCTGTCTTTTCAAGAACTAACGCAAC
AAATTAATATTCAACCTTTAGGCAGGGTGGGAATGTAA


Protein information


Protein_Function: Apparatus     Protein_acession: WP_017096450.1

Protein sequence:

MNKLIDIINKVGQRKDIMLAVMLLAIVFMMILPLPTTLVDVLIG TNMSIAVVLLMIAIY
ITSPLEFSAFPAVLLITTLFRLSLSITTTRLILLQGDAGQIVS TFGNFVVGGNLVVGIV
VFLIITIVQFMVITKGSERVAEVSARFSLDAMPGKQMSIDGD MRAGVIDVHEARHRRSV
IEKESQMYGSMDGAMKFVKGDSIAGLVIIVVNILGGVTIGV TQKGMSASEALELFAVLT
VGDGLVSQIPALFIAITAGIIVTRVSNEESSDLGSDIGAQ VTAQPRALLIGGVLLVLFA
LIPGFPKVTFFVLAIVVGGGGFFLLHNKKQQSKLSSADL PSFVAQGAGSPAAKSNKAAP
QRNSKGKLGEQEEFAMTVPLLIDLDARLQESLEAVALN DELARVRRALYLDLGVPFPGI
HLRFNEGMSNGEYLIQLQEVPVARGRIQSLKLLVTED NEQIDLLGIPYEKDDDFLPGIS
SIWVDHSHKVKLENSQVGFLTPDRILTYHLSHVLKE YAQDFIGIQETRYLLEQMEGSYS
ELVKETQRIVPLQKMTEILQRLVSEDISIRNLRVI LEAMVEWGQKEKDVVQLTEYIRSS
LKRYICYKYASGQNMLPAYLLDQSLEDMLRNGIR QTSSGSYLALDPSVTQQFVSDVKQA
VGDLSRMPNKPVLVVSMDVRRYVRKLIESEYYD LPVLSFQELTQQINIQPLGRVGM