Home
Browse
Blast
Tools
Download
Help

Basic information


Strain: Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633

T3SS: Vib2-c     T3SS_Category: X

Genome_ID: NC_004605.1     Strand: -     Coordinate: 1423630..1425513

Locus_Tag: VPA1355


Gene information


Gene_name: SctV     Gene_acession:

Nucleic acid sequence:

ATGATGGCGAAGTTACGTAAATCATCATTATTGTTTAATCCCAGCAGTGTGATGATTGCGTTTTTATTACCGACAATCAT
TCTAGTGACGCTGCCGGGGATTGTGATCGATTTCTTTTTGATGATCAGTTTTATCAGTTCTGCACTGTTATTGGTCATTA
TGTTAGAAAATGATGAGCCGTTGAAAGTGACGTTTCTACCTACAATGGTTCTCTTACTAACAACGTTTCGTTTGTTGCTT
TCTATTGCGACAACGCGGAATATCATTGCTAATGAAGATGTTGGTCAAGTTATTGAAACGGTTGGTCAGTTTGTTATGGG
GGGGAACTTACTCTCTGGGCTGCTGATTTTCATCATCATTACTATTGTTCAATTTTTAGTAGTAACCAAAGGTGGTGAAC
GCGTTGCTGAAGTTGGTGCTCGCTTCTCTCTGGATGCGTTGCCTGGTAAACAAATGACCATTGATGGGGATTTAAAAAGC
GGCTTAATCACCGGGGAGCAAGCTCAAAAATTACGTGCTGATTTAGGGACAGAAAACAGACTTTTTGGTTCTCTTGATGG
GGCAATGAAGTTTGTTAAAGGTGATGCGATCGCGGGTATTTTGATCAGTTTAGTTAACTTATTCGGCGGTATTTATGTTG
GTATTAACCAGTTTGACCTCTCTTTAGGAGATAGCGTTAGCCGCTTTTCAGTCTTGACAGTAGGGGATGGGTTAGTATCT
CAAATACCAAGTTTATTGCTATCTATGGCATGTGGTGTCTATTTGACACGTATTAAAGGTTCTGATGATGAGTCTAGCTC
ATTTATGTCTCAACTAATGTTGCAAATTCGAACCTTTTGGAAAAGTTTGTTTGTCATTGGTGGCATCATTATTGTCTTGG
GTATTGCTAATCCGAATTTGTTGTATGTGTGCTTGCCTCTCGCAGGGGTTTGTGCCGCGTTAGCGATTTGGCTACAAAAA
AAAGACGGCAGTAAAAATCCAACGCTCAGTTTAGAACCGCAAGGACATGGCTTATTTCAGTCTTTAAAGTTTGTTTTCCG
AGAAGAGCAATATCAGCACTTGATTCAACGACATGTGGAAGAGAAAGAAAAGTCGTTATGGGGACAAGCCCTTGGACTAC
CTGCAGTTGTCGTAGACCCAACGCTTGATTGCGATATCAAGGTGTACATTTCCGATATCGAAATGTACAGCTATAAAAAT
ACTGAACCAGGTGTAGTGATTGAAATTCTTAATGATGAGCTTTTGATGTCAAGTCATGATGTGGTGAGTAATATTAATCA
TATTATAAGCTACTTTATTCATAATCGTTTTGTTGAAAAATATAACCTGCAATACAGCAGCAATATTGTCACAGGTTTAG
AACAACAAAGTGAAATTATGAAAAGCGAGATTGATTCTGCTGTCGGATTAAACCGAGTGCATGATGTACTGAAGCAGATG
ATTCGCTCACCTGAGTTTTATTTGGATCGTGTTAGTTTTTTCGAGGCTCTTATCTATTGGTCACGCGTAGAGAGTGACCC
TCGTAACTGGTTAACACGCATGCGTAGTCAAGCCCGTTATGACATTACAAGCAAATTGTTAAATAGCGAAGGTAAGTTTA
ATGTCATATTACTGACTCCCGAACTTACAGAAGAAATTTCCGGATTTGTTGCTGGTGAGTTTGACGATGCTGAGAGATTG
ATTTCGGTACAAACTACACTGCGTAGCGAAATAAAACGTTTGCTTTTTCAATACGGTTCGAAACCTGTCGTCGTGGTCAA
TGAAAATGAACTGGATTATATAAAATCATTTTTCCAACAAGTTATGAGTAGAATATTTGTATGTAGTCATGCTGATATTG
TTAACTCAAACTGTATTGAAAATACAGATACAATTCATATTTAA


Protein information


Protein_Function: Apparatus     Protein_acession: NP_800865.1

Protein sequence:

MMAKLRKSSLLFNPSSVMIAFLLPTIILVTLPGIVIDFFLMISFISSALLLVIMLENDEPLKVTFLPTMVLLLTTFRLLL
SIATTRNIIANEDVGQVIETVGQFVMGGNLLSGLLIFIIITIVQFLVVTKGGERVAEVGARFSLDALPGKQMTIDGDLKS
GLITGEQAQKLRADLGTENRLFGSLDGAMKFVKGDAIAGILISLVNLFGGIYVGINQFDLSLGDSVSRFSVLTVGDGLVS
QIPSLLLSMACGVYLTRIKGSDDESSSFMSQLMLQIRTFWKSLFVIGGIIIVLGIANPNLLYVCLPLAGVCAALAIWLQK
KDGSKNPTLSLEPQGHGLFQSLKFVFREEQYQHLIQRHVEEKEKSLWGQALGLPAVVVDPTLDCDIKVYISDIEMYSYKN
TEPGVVIEILNDELLMSSHDVVSNINHIISYFIHNRFVEKYNLQYSSNIVTGLEQQSEIMKSEIDSAVGLNRVHDVLKQM
IRSPEFYLDRVSFFEALIYWSRVESDPRNWLTRMRSQARYDITSKLLNSEGKFNVILLTPELTEEISGFVAGEFDDAERL
ISVQTTLRSEIKRLLFQYGSKPVVVVNENELDYIKSFFQQVMSRIFVCSHADIVNSNCIENTDTIHI