Home
Browse
Blast
Tools
Download
Help

Basic information


Strain: Chlamydophila caviae GPIC

T3SS: Chldo-c     T3SS_Category: VII

Genome_ID: NC_003361.3     Strand: -     Coordinate: 517743..519872

Locus_Tag: CCA00459


Gene information


Gene_name: SctV     Gene_acession:

Nucleic acid sequence:

ATGAACAAGTTACTCAATTTTGTCAGTAGAACCTTTGGGGGAGAAGCAGCCCTAAACATGATCAATAAATCGAGTGACCT
CATCCTGGCTCTATGGATGATAGGCGTCGTTTTAATGATCATCTTGCCCCTGCCTCCGACTATTGTCGACTTGATGATCA
CTATCAACTTGGCGGTGTCTGTCTTCCTATTGATGGTGGCTTTGTATATCCCTAGCGCTCTACAATTATCGGTTTTCCCC
TCTCTACTTCTAATTACAACAATGTTTCGTTTGGGAATTAACATTTCCTCATCGAGACAGATTCTCCTTAAAGCATATGC
TGGACACGTCATTCAAGCCTTCGGAGACTTTGTTGTTGGAGGGAACTACGTTGTTGGATTTATTATCTTCTTAATCATTA
CGATTATTCAGTTTATCGTTGTTACCAAAGGTGCTGAGCGTGTTGCCGAGGTTGCTGCGAGATTCCGATTAGATGCTATG
CCTGGTAAGCAGATGGCTATTGACGCCGATTTGCGCGCAGGAATGATTGATGCTCAACAAGCTCGTGATAAACGAGGAAT
GATTCAGAAGGAAAGTGAGCTTTATGGAGCCATGGACGGTGCTATGAAGTTCATTAAAGGGGACGTTATCGCTGGTATCG
TTATCTCTTTAATTAACATCGTTGGTGGTTTGACCATTGGTGTCGCCATGCACGGTATGGACCTTGCTCAAGCTGCACAC
GTCTACACTCTTTTATCTATCGGTGATGGATTAGTCTCTCAGATTCCTTCACTACTTATCTCTTTAACTGCTGGTATCGT
GACTACTCGAGTTTCTAGTGACAAAAACACGAACTTGGGTAAAGAGATTTCTTCTCAATTAGTTAAAGAACCTAGAGCGT
TGCTCCTCGCTGGCGCAGCAACTTTAGGTGTGGGCTTCTTTAAAGGCTTCCCACTTTGGTCATTCTCCATTCTCGCTTTC
ATCTTCGGCCTGCTTGGAGTTATCCTTCTTGCTAAGAAAAATAACGCCTCTAAAAAAGGTGCATCGGGAGCAACAACAAC
GGTGGGGGCTGCTGCCGATGGAGCAGCAACAGCTGGCGACAATCCAGACGATTATGCGCTAACCCTCCCTGTCATTTTAG
AGTTAGGAAAAGATCTATCTAAGTTAATTCAACAGAGAACAAAATCTGGTCAAAGCTTCATTGATGATATGATCCCTAAA
ATGCGTCAGGCTTTGTATCAAGATATCGGTATCCGTTATCCAGGAATTCACGTACGTACTGATTCTCCTTCATTAGAAGG
GTACGACTACATGATCCTTCTTAATGAAGTTCCTTATGTTCGAGGTAAGGTACCTCCAAATCACGTATTGACTAATGAAG
TAGAAGAGAATCTTAAAAGATATAACCTCCCCTTCATTACCTATAAAAATGCTGCGGGACTACCTTCAGCTTGGGTTAGT
GAAGATGCTAAAACCATTCTCGAAAAAGCAGCTATTAAATACTGGACACCTTTAGAAGTAATTATTCTTCATCTTTCGTA
CTTCTTCCATAGAAGCTCTCAAGAGTTCTTGGGAATTCAAGAAGTGCGCTCTATGATTGAATTTATGGAACGTTCCTTCC
CTGATCTCGTTAAGGAAGTTACCCGCCTTATTCCTCTACAAAAACTTACAGAGATTTTCAAACGTCTAGTCCAAGAGCAA
ATCTCTATTAAGGATTTGCGCACGATTTTAGAATCATTAAGTGAATGGGCTCAGACAGAAAAAGATACCGTATTACTTAC
TGAATACGTACGTTCTTCTCTTAAACTCTATATTAGCTTTAAATTTTCTCAGGGCCAATCTGCAATTTCTGTCTATTTAT
TAGATCCAGAAATTGAAGAAATGATCCGTGGAGCAATTAAGCAAACTTCTGCGGGATCTTATCTTGCCTTGGATCCTGAT
TCTGTAAATCTCATCTTAAAATCTATGAGAAATACAATTACGCCAACACCTCCTGGAGGTCAGCCTCCTGTGCTGTTGAC
AGCAATTGACGTAAGACGATATGTAAGGAAATTAATAGAGACAGAATTCCCTGATATCGCTGTGATTTCTTATCAAGAGA
TTCTCCCAGAGATTCGCATCCAGCCATTAGGAAGAATTCAGATTTTCTAA


Protein information


Protein_Function: Apparatus     Protein_acession: NP_829327.1

Protein sequence:

MNKLLNFVSRTFGGEAALNMINKSSDLILALWMIGVVLMIILPLPPTIVDLMITINLAVSVFLLMVALYIPSALQLSVFP
SLLLITTMFRLGINISSSRQILLKAYAGHVIQAFGDFVVGGNYVVGFIIFLIITIIQFIVVTKGAERVAEVAARFRLDAM
PGKQMAIDADLRAGMIDAQQARDKRGMIQKESELYGAMDGAMKFIKGDVIAGIVISLINIVGGLTIGVAMHGMDLAQAAH
VYTLLSIGDGLVSQIPSLLISLTAGIVTTRVSSDKNTNLGKEISSQLVKEPRALLLAGAATLGVGFFKGFPLWSFSILAF
IFGLLGVILLAKKNNASKKGASGATTTVGAAADGAATAGDNPDDYALTLPVILELGKDLSKLIQQRTKSGQSFIDDMIPK
MRQALYQDIGIRYPGIHVRTDSPSLEGYDYMILLNEVPYVRGKVPPNHVLTNEVEENLKRYNLPFITYKNAAGLPSAWVS
EDAKTILEKAAIKYWTPLEVIILHLSYFFHRSSQEFLGIQEVRSMIEFMERSFPDLVKEVTRLIPLQKLTEIFKRLVQEQ
ISIKDLRTILESLSEWAQTEKDTVLLTEYVRSSLKLYISFKFSQGQSAISVYLLDPEIEEMIRGAIKQTSAGSYLALDPD
SVNLILKSMRNTITPTPPGGQPPVLLTAIDVRRYVRKLIETEFPDIAVISYQEILPEIRIQPLGRIQIF