| Strain | GI_acc | Best_hit | Family |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166153983 | Chldi_Chldi_CT642 | NLED |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166153989 | Chldo_Chldo_Cpn0774 | Chldo_Chldo_Cpn0774 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166153994 | Chldi_Chldi_CT652.1 | CPN0764 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154008 | Chldi_Chldi_CdsF | HRPY |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154036 | Chldi_Chldi_CTL0063 | CT694 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154037 | Chldi_Chldi_CTL0064 | CT695 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154038 | Chldi_Chldi_CTL0065 | Chldi_Chldi_CTL0065 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154054 | Chldi_Chldi_CT712 | CT621 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154060 | Chldi_Chldi_CT718 | CT718 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154080 | Chldi_Chldi_YycJ | YYCJ |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154191 | Chldi_Chldi_CT847 | Chldi_Chldi_CT847 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154192 | Chldi_Chldi_CT848 | CT848 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154193 | Chldo_Chldo_Cpn1020 | CT848 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154206 | Chldi_Chldi_CopD2 | COPD2 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154207 | Chldi_Chldi_CopB2 | COPB |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154209 | Chldi_Chldi_CT863 | CT863 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154274 | Chldi_Chldi_CT053 | Chldi_Chldi_CT053 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154277 | Chldo_Chldo_Cpn0490 | Chldo_Chldo_Cpn0490 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154303 | Chldi_Chldi_CT082 | Chldi_Chldi_CT082 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154304 | Chldi_Chldi_CT083 | CT083 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154309 | Chldo_Chldo_IncB | Chldo_Chldo_IncB |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154310 | Chldi_Chldi_CopN | Chldi_Chldi_CopN |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154326 | Chldi_Chldi_CT105 | Chldi_Chldi_CT105 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154337 | Chldi_Chldi_IncE | YOPT |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154339 | Chldi_Chldi_IncG | Chldi_Chldi_IncG |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154340 | Chldi_Chldi_IncA | INCAC |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154363 | Chldi_Chldi_CT142 | Chldi_Chldi_CT142 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154364 | Chldi_Chldi_CT143 | Chldi_Chldi_CT143 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154377 | Chldi_Chldi_CT161 | Chldi_Chldi_CT161 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154413 | Chldo_Chldo_Cpn0374 | Chldo_Chldo_Cpn0374 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154434 | Chldi_Chldi_CT223 | INCAC |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154440 | Chldi_Chldi_CT229 | INCAC |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154443 | Chldo_Chldo_Cpn0026 | Chldo_Chldo_Cpn0026 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154444 | Chldi_Chldi_IncC | INCC |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154499 | Chldi_Chldi_CT288 | Chldi_Chldi_CT288 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154549 | Chldi_Chldi_CT338 | Chldi_Chldi_CT338 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154576 | Chldo_Chldo_Cpn0648 | Chldo_Chldo_Cpn0648 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154598 | Chldo_Chldo_Cpn0671 | Chldo_Chldo_Cpn0671 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154642 | Chldi_Chldi_CT429 | Chldi_Chldi_CT429 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154655 | Chldi_Chldi_CrpA | Chldi_Chldi_CrpA |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154670 | Chldi_Chldi_Tarp | Chldi_Chldi_Tarp |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154744 | Chldi_Chldi_Cap1 | CAP1 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154765 | Chldi_Chldi_CT550 | CT550 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154781 | Chldo_Chldo_Cpn0859 | Chldo_Chldo_Cpn0859 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154793 | Chldi_Chldi_CopB | COPB |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154794 | Chldi_Chldi_CopD | YOPBD |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154821 | Chldi_Chldi_CT606.1 | CPN0853 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154825 | Chldi_Chldi_CT610 | CT610 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154833 | Chldi_Chldi_CT618 | Chldi_Chldi_CT618 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154835 | Chldi_Chldi_CT621 | CT621 |
| Chlamydia trachomatis 434_Bu | 166154836 | Chldi_Chldi_CT621 | CT621 |
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