| Strain | GI_acc | Best_hit | Family |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499776831 | Chldi_Chldi_CT618 | Chldi_Chldi_CT618 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499776840 | Chldi_Chldi_CT610 | CT610 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499776843 | Chldo_Chldo_Cpn0774 | Chldo_Chldo_Cpn0774 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499776849 | Chldo_Chldo_Cpn0821 | NLED |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499776853 | Chldo_Chldo_Cpn0853 | CPN0853 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499776882 | Chldo_Chldo_CopD | YOPBD |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499776883 | Chldi_Chldi_CopB | COPB |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499776895 | Chldo_Chldo_Cpn0859 | Chldo_Chldo_Cpn0859 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499776923 | Chldi_Chldi_CT712 | CT621 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499776949 | Chldo_Chldo_Cpn1019 | YYCJ |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777076 | Chldi_Chldi_CT847 | Chldi_Chldi_CT847 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777077 | Chldo_Chldo_Cpn1020 | CT848 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777078 | Chldo_Chldo_Cpn1020 | CT848 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777093 | Chldo_Chldo_CopD2 | COPD2 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777094 | Chldo_Chldo_CopB2 | COPB |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777096 | Chldo_Chldo_Cpn1022 | CT863 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777105 | Chldo_Chldo_Cpn1032 | HOPAZ |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777215 | Chldo_Chldo_Cpn0374 | Chldo_Chldo_Cpn0374 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777302 | Chldi_Chldi_CT143 | Chldi_Chldi_CT143 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777303 | Chldi_Chldi_CT142 | Chldi_Chldi_CT142 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777335 | Chldi_Chldi_IncC | INCC |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777367 | Chldi_Chldi_CopN | Chldi_Chldi_CopN |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777368 | Chldo_Chldo_IncB | Chldo_Chldo_IncB |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777373 | Chldo_Chldo_Cpn0474 | CT083 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777374 | Chldi_Chldi_CT082 | Chldi_Chldi_CT082 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777403 | Chldo_Chldo_Cpn0490 | Chldo_Chldo_Cpn0490 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777406 | Chldi_Chldi_CT053 | Chldi_Chldi_CT053 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777437 | Chldi_Chldi_CT105 | Chldi_Chldi_CT105 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777471 | Chldi_Chldi_CT288 | Chldi_Chldi_CT288 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777492 | Chldi_Chldi_CT338 | Chldi_Chldi_CT338 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777555 | Chldo_Chldo_Cpn0648 | Chldo_Chldo_Cpn0648 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777563 | Chldo_Chldo_ChlaOTU | Chldo_Chldo_ChlaOTU |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777571 | Chldo_Chldo_Cpn0671 | Chldo_Chldo_Cpn0671 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777595 | Chldi_Chldi_CT429 | Chldi_Chldi_CT429 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777650 | Chldi_Chldi_Tarp | Chldi_Chldi_Tarp |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777664 | Chldo_Chldo_Cpn0330 | Chldo_Chldo_Cpn0330 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777725 | Chldo_Chldo_Cpn0725 | CAP1 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777747 | Chldo_Chldo_Cpn0761 | CT550 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777751 | Chldi_Chldi_CTL0065 | Chldi_Chldi_CTL0065 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777752 | Chldi_Chldi_CTL0064 | CT695 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777784 | Chldi_Chldi_CdsF | HRPY |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 499777800 | Chldi_Chldi_CT621 | CT621 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 752831623 | Chldo_Chldo_Cpn1005 | CT718 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 752831781 | Esc_LEE_LifA | Esc_LEE_LifA |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 752831782 | Chldi_Chldi_IncA | INCAC |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 752831790 | Chldi_Chldi_CT105 | Chldi_Chldi_CT105 |
| Chlamydophila felis Fe_C-56 | 752831806 | Chldi_Chldi_CrpA | Chldi_Chldi_CrpA |
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