| Strain | GI_acc | Best_hit | Family |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477462 | Chldo_Chldo_Cpn1022 | CT863 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477464 | Chldo_Chldo_CopB2 | COPB |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477465 | Chldo_Chldo_CopD2 | COPD2 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477479 | Chldo_Chldo_Cpn1020 | CT848 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477480 | Chldo_Chldo_Cpn1020 | CT848 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477482 | Chldi_Chldi_CT847 | Chldi_Chldi_CT847 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477597 | Chldo_Chldo_Cpn1019 | YYCJ |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477618 | Chldo_Chldo_Cpn1005 | CT718 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477623 | Chldo_Chldo_YycJ | CT621 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477651 | Chldo_Chldo_Cpn0859 | Chldo_Chldo_Cpn0859 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477663 | Chldo_Chldo_CopB | COPB |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477664 | Chldo_Chldo_CopD | YOPBD |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477695 | Chldo_Chldo_Cpn0853 | CPN0853 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477700 | Chldo_Chldo_Cpn0821 | NLED |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477713 | Chldi_Chldi_CT618 | Chldi_Chldi_CT618 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477787 | Chldi_Chldi_CT695 | CT695 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477788 | Chldi_Chldi_CTL0065 | Chldi_Chldi_CTL0065 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477791 | Chldo_Chldo_Cpn0761 | CT550 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477866 | Chldo_Chldo_Cpn0774 | Chldo_Chldo_Cpn0774 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477888 | Chldi_Chldi_Tarp | Chldi_Chldi_Tarp |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477946 | Chldi_Chldi_CT429 | Chldi_Chldi_CT429 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477970 | Chldo_Chldo_Cpn0671 | Chldo_Chldo_Cpn0671 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477978 | Chldo_Chldo_ChlaOTU | Chldo_Chldo_ChlaOTU |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477986 | Chldo_Chldo_Cpn0648 | Chldo_Chldo_Cpn0648 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503477993 | Chldi_Chldi_CT288 | Chldi_Chldi_CT288 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478043 | Chldi_Chldi_CT338 | Chldi_Chldi_CT338 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478097 | Chldi_Chldi_CT105 | Chldi_Chldi_CT105 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478101 | Chldi_Chldi_CT105 | Chldi_Chldi_CT105 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478125 | Chldi_Chldi_CT053 | Chldi_Chldi_CT053 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478128 | Chldo_Chldo_Cpn0490 | Chldo_Chldo_Cpn0490 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478163 | Chldi_Chldi_CT082 | Chldi_Chldi_CT082 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478164 | Chldo_Chldo_Cpn0474 | CT083 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478171 | Chldo_Chldo_IncB | Chldo_Chldo_IncB |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478172 | Chldi_Chldi_CopN | Chldi_Chldi_CopN |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478240 | Chldi_Chldi_CT142 | Chldi_Chldi_CT142 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478241 | Chldi_Chldi_CT143 | Chldi_Chldi_CT143 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478283 | Esc_LEE_LifA | Esc_LEE_LifA |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478290 | Esc_LEE_LifA | Esc_LEE_LifA |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478300 | Chldo_Chldo_IncC | INCAC |
| Chlamydophila pecorum E58 | 503478440 | Chldo_Chldo_Cpn1032 | HOPAZ |
| Chlamydophila pecorum E58 | 545648657 | Chldi_Chldi_CdsF | HRPY |
| Chlamydophila pecorum E58 | 737428238 | Chldi_Chldi_IncC | INCC |
| Chlamydophila pecorum E58 | 752830700 | Chldo_Chldo_Cpn0774 | Chldo_Chldo_Cpn0774 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 752830704 | Chldi_Chldi_CTL0063 | CT694 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 752830708 | Chldo_Chldo_Cpn0330 | Chldo_Chldo_Cpn0330 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 752830719 | Chldi_Chldi_CT288 | Chldi_Chldi_CT288 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 752830766 | Chldi_Chldi_CT621 | CT621 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 752830769 | Chldo_Chldo_Cpn0725 | CAP1 |
| Chlamydophila pecorum E58 | 752830772 | Chldi_Chldi_CrpA | Chldi_Chldi_CrpA |
| Chlamydophila pecorum E58 | 752830790 | Chldo_Chldo_Cpn0026 | Chldo_Chldo_Cpn0026 |
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