TxSEdb

Basic Information

TxSEdb_ID: T3SE_00525

Protein_Name: tir

Protein_Acc: NP_290261.1

Gene_Name: tir

Gene_LocusTag: Z5112

Gene_ID: 960860

Genome_ID: NC_002655.2

Gene_Coordinates: complement(4668913 - 4670589)

Protein_Other_Acc: NP_290261.1

Category: -

Species|Genus: Escherichia coli O157:H7 str. EDL933

Strain: EDL933

Protein_Sequence:

MPIGNLGHNPNVNNSIPPAPPLPSQTDGAGGRGQLINSTGPLGSRALFTPVRNSMADSGDNRASDVPGLPVNPMRLAASEITLNDGFEVLHDHGPLDTLNRQIGSSVFRVETQEDGKHIAVGQRNGVETSVVLSDQEYARLQSIDPEGKDKFVFTGGRGGAGHAMVTVASDITEARQRILELLEPKGTGESKGAGESKGVGELRESNSGAENTTETQTSTSTSSLRSDPKLWLALGTVATGLIGLAATGIVQALALTPEPDSPTTTDPDAAASATETATRDQLTKEAFQNPDNQKVNIDELGNAIPSGVLKDDVVANIEEQAKAAGEEAKQQAIENNAQAQKKYDEQQAKRQEELKVSSGAGYGLSGALILGGGIGVAVTAALHRKNQPVEQTTTTTTTTTTTSARTVENKPANNTPAQGNVDTPGSEDTMESRRSSMASTSSTFFDTSSIGTVQNPYADVKTSLHDSQVPTSNSNTSVQNMGNTDSVVYSTIQHPPRDTTDNGARLLGNPSAGIQSTYARLALSGGLRHDMGGLTGGSNSAVNTSNNPPAPGSHRFV

Show More Show Less

CDS_Sequence:

ATGCCTATTGGTAATCTTGGTCATAATCCCAATGTGAATAATTCAATTCCTCCTGCACCTCCATTACCTTCACAAACCGACGGTGCAGGGGGGCGTGGTCAGCTCATTAACTCTACGGGGCCGTTGGGATCTCGTGCGCTATTTACGCCTGTAAGGAATTCTATGGCTGATTCTGGCGACAATCGTGCCAGTGATGTTCCTGGACTTCCTGTAAATCCGATGCGCCTGGCGGCGTCTGAGATAACACTGAATGATGGATTTGAAGTTCTTCATGATCATGGTCCGCTCGATACTCTTAACAGGCAGATTGGCTCTTCGGTATTTCGAGTTGAAACTCAGGAAGATGGTAAACATATTGCTGTCGGTCAGAGGAATGGTGTTGAGACCTCTGTTGTTTTAAGTGATCAAGAGTACGCTCGCTTGCAGTCCATTGATCCTGAAGGTAAAGACAAATTTGTATTTACTGGAGGCCGTGGTGGTGCTGGGCATGCTATGGTCACCGTTGCTTCAGATATCACGGAAGCCCGCCAAAGGATACTGGAGCTGTTAGAGCCCAAAGGGACCGGGGAGTCCAAAGGTGCTGGGGAGTCAAAAGGCGTTGGGGAGTTGAGGGAGTCAAATAGCGGTGCGGAAAACACCACAGAAACTCAGACCTCAACCTCAACTTCCAGCCTTCGTTCAGATCCTAAACTTTGGTTGGCGTTGGGGACTGTTGCTACAGGTCTGATAGGGTTGGCGGCGACGGGTATTGTACAGGCGCTTGCATTGACGCCGGAGCCGGATAGCCCAACCACGACCGACCCTGATGCAGCTGCAAGTGCAACTGAAACTGCGACAAGAGATCAGTTAACGAAAGAAGCGTTCCAGAACCCAGATAATCAAAAAGTTAATATCGATGAGCTCGGAAATGCGATTCCGTCAGGGGTATTGAAAGATGATGTTGTTGCGAATATAGAAGAGCAGGCTAAAGCAGCAGGCGAAGAGGCCAAACAGCAAGCCATTGAAAATAATGCTCAGGCGCAAAAAAAATATGATGAACAACAAGCTAAACGCCAGGAGGAGCTGAAAGTTTCATCGGGGGCTGGCTACGGTCTTAGTGGCGCATTGATTCTTGGTGGGGGAATTGGTGTTGCCGTCACCGCTGCGCTTCATCGAAAAAATCAGCCGGTAGAACAAACAACAACAACAACTACTACAACTACAACTACAAGCGCACGTACGGTAGAGAATAAGCCTGCAAATAATACACCTGCACAGGGCAATGTAGATACCCCTGGGTCAGAAGATACCATGGAGAGCAGACGTAGCTCGATGGCTAGCACCTCGTCGACTTTCTTTGACACTTCCAGCATAGGGACCGTGCAGAATCCGTATGCTGATGTTAAAACATCGCTGCATGATTCGCAGGTGCCGACTTCTAATTCTAATACGTCTGTTCAGAATATGGGGAATACAGATTCTGTTGTATATAGCACCATTCAACATCCTCCCCGGGATACTACTGATAACGGCGCACGGTTATTAGGAAATCCAAGTGCGGGGATTCAAAGCACTTATGCGCGTCTGGCGCTAAGTGGTGGATTACGCCATGACATGGGAGGATTAACGGGGGGGAGTAATAGCGCTGTGAATACTTCGAATAACCCACCAGCGCCGGGATCCCATCGTTTCGTCTAA

Show More Show Less

Promoter_Sequence:

CCCTGGAGGGGATCTTAGCTGAAAGAGGATTATCTTCTTTGTTACGTCGTGTACAGTCTACCGAACGTCTTGATAATAGGGCTATAGCAACAAGAGCTTCCTCTTATAGCGTATTATGATTAGCATTTGAGTTTTCTTCCTGACTTAACTCCAGAATAGTTATAATTCTGGAGTTTTTCCGCTTTTTAACTGATATTACATTGCTTTTAGATAATACAGGCTGAATCTTCAGAGACGTTAGCGGCCAGAAATCAGAGGTCCCTGTGATGAAGAGTATGTTAAACGGAATGGATGATCCCATCCAGCGCAGAAATTATCAAGGTAAAAAATCTGTAGGTCTGGAAGACAAGGATCTAATTATCTCATTCTTTAATAGATAACCATTTTCCATTAAATTAGCAAACTCTGTAATATCAATTTTATCTGCAGGAAATGCAATATTTAAAAGAATGTTGTCATCTTTTAATGACAGGAAAAACATACCGAGCAGTTCTCGATTGCTATTCATTTCAAGTATTGAATTAATCTGTATTGATTCGCTATTCAATAAATAACAATAAAAAAACAGAATTTCAGATTGAGATGCACACTCCAGTATCCATTCATGGCCATCGTTATCGTGGAAAGAGAGCACGTCAGTTTGCTCTTCAAGAGCTATCCCAAACGTATGTGCAAGGTCTGTGCGAAATTTCTCATTCATATTGTAGTCCTGCCATTCTTTTCATGTTGATATACTCAAACGTAATTAATCCGAGAGTTCTGATACAAATAATAAGGCGTAGATATAAGATTACGGGAATAGTGTTGCATATTCATGATAGCATATGATAAATGTAGTGCAACTACCTGTAGATAAGGCCGGAGGATAATTCAAATATAAATACAAGATAATTATTCTTTAAAGTTATTTTTTAATGGGAAGCAATTTTTTTACTGTCGAAATATAATTTATAAAGGTTTATGGTATGTTTAGTCCAATGACAATGGCAGGCAGATCGTTAGTTCAGGCGACTGCACAGACGCTTAAACCTGCGGTTACCAGAGCTGCAATGCAAGCGGGTACGGGAGCCACGGGTATGAGGTTCATGCCCGTGCAGTCGAACTTTGTGATTAATCATGGCAAACTGACTAACCAACTCCTGCAGGCTGTAGCCAAACAAACTCGTAATGGCGATACCCAACAATGGTTCCAGCAGGAGCAGACGACTTATATATCCAGAACAGTAAATAGAACTCTGGATGACTATTGCAGGAGTAATAATTCGGTCATTAGTAAGGAGACTAAAGGTCACATTTTTAGAGCTGTTGAAAATGCGTTACAGCAACCTCTTGATATGAACGGGGCACAATCATCAATTGGTCACTTCTTGCAGTCCAATAAATACTTTAATCAGAAAGTTGATGAGCAGTGCGGCAAAAGAGTGGATCCAATAACACGTTTTAACACCCAGACGAAGATGATAGAACAAGTCTCACAAGAAATATTTGAACGCAACTTTAGCGGCTTCAAAGTCAGTGAGATAAAAGCGATTACTCAGAATGCGATTTTAGAGCATGTACAGGATACCCGATTGTAGGGATAACCTTGTCAGGTATAAATTAAGCTTCCTGGTGTATAGCATGGCCTTTGTTGATGTAAGAAAAAACGCGATAAAGAAACTTAATAAACTTTATTATTAATTAAGATTTATAGTTTGCTTAATTGGTTTTCTTTGGCTGTGTTTTTTAATATAAATGAATGTTTGCTGCAATTTTATTTATGAAATGTTTTATTAAGATTTCACGTGGTGTTTACTTTTATATAATATAATTATTTTTATTTTGTTACCCGATGTGTGTTTTTAGCACATTATTTTCTTGCATCAAAAATCAGATTGTGATTTATTTGGTCGATGTCATGTTCAGCCGTTTATCGACTACGTGCTGTATACCATACATTATTATGTAATAGCAAAATAAAGGATTGTTATCTATTTACATAAAATAAAAAGGAGATATTT

Show More Show Less

PMID: 11685226 17521329 16954405 16228285 15527496